Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDLRP01130 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRP01130 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms