Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F9P00740 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F9P00740 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F9P00740 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms