Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KLF12Q9Y4X4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KLF12Q9Y4X4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms