Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms