Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms