Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms