Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms