Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms