Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms