Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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RDH8Q9NYR8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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