Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms