Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG4Q9H9E3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG4Q9H9E3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms