Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms