Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZYG11BQ9C0D3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms