Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms