Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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