Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRIP1Q9BX63 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms