Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GGACTQ9BVM4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms