Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms