Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTV1Q96GA3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms