Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms