Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms