Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG3Q8WXD2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms