Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPC24Q8NBT2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPC24Q8NBT2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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