Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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