Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms