Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN3Q5MJ09 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms