Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC27A3Q5K4L6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms