Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms