Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA3Q53S33 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms