Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYTL3Q4VX76 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms