Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q499Y3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q499Y3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q499Y3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q499Y3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q499Y3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q499Y3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q499Y3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q499Y3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q499Y3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms