Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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