Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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