Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCF4Q15080 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms