Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms