Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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