Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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