Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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