Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FOXE3Q13461 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FOXE3Q13461 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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