Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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