Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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RPA4Q13156 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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RPA4Q13156 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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RPA4Q13156 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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