Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RLFQ13129 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RLFQ13129 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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