Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms