Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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