Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
STX4Q12846 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
STX4Q12846 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
STX4Q12846 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
STX4Q12846 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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