Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms