Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms