Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms