Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP1Q00587 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms